Состав прединтеграционного комплекса

Для анализа экстракт из цитоплазмы клеток через 6 часов после внесения в культуру клеток Sup Т1 вируса ВИЧ-1 фракционировали центрифугированием в градиенте сахарозы, как до, так и после депротеинизации. Каждую фракцию исследовали методом Southern blot, то есть электрофорезом и гибридизацией со специфическими нуклеиновыми зондами на ДНК ВИЧ. Депротеинизированная линейная ДНК провируса седиментирует медленно и оказывается во фракции в самом верху градиента сахарозы. Напротив, в недепротеинизированном препарате вирусная ДНК оказывается во фракции с мобильностью около 80 S. Этот комплекс «80S» оказался довольно стабильным и его удалось очистить от примесей хроматографией на колонке с сефадексом. Авторы выделили эту структуру «80S» и исследовали ее способность к прямой интеграции в модельную двуспиральную структуру ДНК ФХ174. Процесс интеграции контролировали методически по сдвигу электрофоретической подвижности. Результат показал, что интеграция полностью завершается за 30 минут при 37°С.