Т-лимфотропные ретровирусы от 4-х видов обезьян

В настоящее время выделены и охарактеризованы Т-лимфотропные ретровирусы от 4-х видов обезьян:

• 1) макаков (Масаса mulatta) – SIVmac;
• 2) африканских зеленых обезьян (African green monkeys – Cercopithecus acthiops) – SIVagm;
• 3) черных мангабеев (Sooty mangabey – Cercocebus atyc) – SIVsmm;
• 4) мандриллов (Mandrills – Papio sphinx) – SIVmnd.

Для всех этих вирусов определены (у того или иного числа изолятов) полные последовательности нуклеотидов в геноме. Сравнение последовательностей аминокислот в продукте гена pol (полимеразы) показало, что вышеназванные вирусы по подобию (степени гомологии) разбиваются на 4 группы. Особняком стоят ВИЧ-1, а также SIVagm и SIVmnd – они похожи только сами на себя и ни на кого больше. Остальные вирусы – ВИЧ-2, SIVmac, SIVsmm – похожи между собой и составляют одну группу. Любопытно, что стоящие особняком группы вирусов имеют статистически одинаковый процент подобия состава – 55-60% – с любой другой из приведенных групп вирусов.
Напомним, что состав генов и структура геномов у ВИЧ-1, ВИЧ-2 и всех SIV принципиально подобны. У ВИЧ-1 и ВИЧ-2 есть по одному уникальному гену: у ВИЧ-1 это Vpu, которого нет у ВИЧ-2 и ни у одного из вирусов обезьян, а у ВИЧ-2 это Vpx, которого нет у ВИЧ-1. Зато Vpx есть также у SIVagm, SIVsmm и SIVmac. Vpx не найден у SIVmnd. У SIVmnd нет также Vpu и Vpr. Vpr не обнаружен также у SIVagm.
Из этих гомологии представляется вероятным, что ВИЧ-2 мог произойти путем межвидового переноса обезьяньих вирусов SIVmac/SIVsmm на человека. В пользу такого представления о естественной истории инфекции человека говорит и совпадение географических зон распространения в природе SIVmac/SIVsmm и ВИЧ-2 – это Западная Африка. Случаи обнаружения ВИЧ-2 у людей в других районах Земли находят объяснение в перемещении этих лиц или заразивших их людей из/через районы Западной Африки.
Какой вирус является ближайшим предшественником ВИЧ-1 – до сих пор неизвестно. Маловероятно, чтобы ВИЧ-1 произошел от какого-то неизвестного непатогенного вируса человека, так как в таком случае в крови многих людей можно было бы выявить антитела, перекрестно реагирующие с антигенами ВИЧ-1. Опыт показывает обратное: уже достаточно многочисленные данные по серодиагностике инфекции ВИЧ повсеместно на Земле говорят о том, что антитела к ВИЧ-1 в крови человека специфичны именно для инфекции вирусом иммунодефицита человека 1-го типа с вероятностью, превышающей 90%  [McCIure М.О. et al., 1989].
Мы позволим себе не рассматривать встречающиеся в литературе изредка предположения о том, что ВИЧ-1 сконструирован искусственно как биологическое оружие. Научной информации в пользу этой гипотезы в доступных нам источниках нет. Единственная идейная предпосылка этих предположений состоит в том, что современная генетическая инженерия может, вообще говоря, так много (и с этим мы согласны), что и это тоже.
Распространенность ВИЧ-1 по географическим зонам Земли в настоящее время является повсеместной. Ретроспективный анализ динамики его распространения не позволяет пока что сделать ясного заключения о первоисточнике в происхождении ВИЧ-1. Фактом является только очередность континентов: сначала Африка и Северная Америка (что из них первое -наверняка также неизвестно), затем Европа, Австралия и позже других Азия.