Происхождение вируса – возбудителя СПИД человека

В представлениях о филогенезе ВИЧ существуют два устойчивых момента, не изменяющихся на протяжении всех 10 лет, в течение которых мы знаем о СПИД. Первый – ВИЧ с самого начала, то есть с первой работы, в которой он был открыт, занял свое неизменное до сих пор место в таксономической классификации вирусов, а именно, в семействе ретровирусов (Retroviridae), подсемействе лентивирусов (Lentiviridae). Второй – история его происхождения (то есть какой именно другой вирус является непосредственным предком ВИЧ-1 и когда во времени ВИЧ появился в человеческой популяции) неизвестны совсем. То есть, вся наша развивающаяся сумма знаний о ВИЧ пока является сиюминутным представлением и неисторична.
В самой первой работе по выделению вируса из лимфоузла больного с лимфоаденопатией вирусологами и электронными микроскопистами из лаборатории L. Montagnier, и даже раньше – в теоретическом предсказании R.C. Gallo, новый вирус классифицировали очень точно – семейство ретровирусов. Главное общее свойство, определяющее принадлежность вирусов к этому семейству – наличие в их природной биологии процесса обратной транскрипции генома, то есть преобразования генома в жизненном цикле вирусов идут в последовательности «РНК → ДНК → РНК». Геном зрелого вириона представлен РНК. В начале его жизненного цикла после успешной инфекции ВИЧ в клетку на геномной РНК как на матрице синтезируется ДНК с помощью особого вирусного фермента – обратной транскриптазы (RT – Reverse Transcriptase). Именно эта ДНК, называемая провирусом, работает как матрица при создании вещества для новых дочерних вирионов, то есть с нее транскрибируется информационная РНК, с которой транслируются вирусные белки. С нее же транскрибируется полноразмерная геномная РНК для новых вирионов.
ВИЧ относится к подсемейству так называемых медленных ретровирусов -лентивирусов (от лат. «lente» – медленный). Главный характерный признак лентивирусов – медленная и неодинаковая скорость развития инфекционного процесса в макроорганизме. То есть, для всех лентивирусных инфекций характерен продолжительный средний инкубационный период. Считается также, что лентивирусы по природе не являются первично онкогенными.
Известно всего семь видов лентивирусов [Gelderblom H.R. et al., 1989]. Все они видоспецифичны, но не абсолютно, то есть каждый инфицирует животных одного или двух видов:

• 1. Вирус инфекционной анемии лошадей – EIAV – Equine infectious anemia virus.
• 2. Вирус меди-висна (maedi-visna) овец. Иначе он иногда называется ОРР – Ovine Progressive Pneumonia – вирус, вызывающий заболевание, проявляющееся в синдромах общего истощения (wasting) и нарушения функции дыхания (dyspnea).
• 3. Вирус артрита-энцефалита коз и овец – CAEV – Caprine-ovine arthritis-encephalitis virus.
• 4. Вирус иммунодефицита крупного рогатого скота – BIV – Bovine immunodeficiency virus.
• 5. Вирус иммунодефицита кошек – FIV – Feline immunodefitiency virus (первое его название – вирус лейкемии кошек – FeLV).
• 6. Вирус иммунодефицита обезьян – SIV – Simian immunedeficiency virus.
• 7. Вирус иммунодефицита человека – ВИЧ, в английской аббревиатуре HIV – Human immunedeficiency virus.

Все эти вирусы имеют очень похожую электронномикроскопическую морфологию, на что и обратили внимание сотрудники L. Montagnier в своей первой работе по выделению ВИЧ: округлой формы вирионы с вытянутым по диаметру нуклеоидом.
Вызываемые лентивирусами заболевания характеризуются рядом общих черт. В английском языке все эти заболевания называют общим термином debilitating diseases, то есть изнуряющие, вызывающие общую слабость организма. Общие черты этих болезней следующие:

• 1. Продолжительный и не имеющий точных средних сроков инкубационный период – от 1 месяца до 10 и больше лет.
• 2. Незаметное, клинически бессимптомное начало заболевания.
• 3. Медленно-прогрессирующее нарастание клинической патологии.
• 4. Патогенез опосредован через иммунные механизмы в большей степени, или, по крайней мере, в первую очередь во времени, чем через прямое повреждающее действие вируса на инфицированные клетки-мишени.
• 5. Высокая скорость генетической изменчивости вирусов.

Ни для одного из лентивирусов к 1991г. не получено эффективной вакцины. Для установления  истории  происхождения ВИЧ сбор экспериментальных данных и анализ информации ведут по трем основным темам:

• 1. сравнительный анализ геномов разных вирусов,
• 2. такой эпидемиологический параметр как локализация и движение ВИЧ в разных регионах Земли и сопоставление этих сведений о ВИЧ с аналогичными сведениями о других вирусах – возможных предшественниках,
• 3. сходство и отличие клинических и лабораторных симптомов вызываемых вирусами болезней.

Лентивирусы животных хотя и открыты раньше ВИЧ, изучены меньше, так как относительно редкие заболевания сельскохозяйственных и домашних животных не явились, в отличие от СПИД человека, уважительным поводом для применения сильного, но дорогостоящего и трудоемкого современного научного методического аппарата. В настоящее время по степени изученности ВИЧ на первом месте среди этих вирусов, вирусы иммунодефицита обезьян (SIV)  -  на втором. Поэтому  подробный сравнительный анализ состава и строения возможен пока только между ВИЧ и SIV. Поскольку определенные участки генома ВИЧ, например, ген env, сильно изменчивы в пределах вида «ВИЧ» (до   25%   нуклеотидного   состава),   то   в   целях установления
возможной исторической взаимосвязи между вирусами разных видов – ВИЧ и SIV – сравнивают последовательности нуклеотидов или аминокислот наиболее консервативных участков генома или их белковых продуктов, а именно гена pol.